El Cejis es una institución privada que se asume como actor social y político autónomo de partidos y confesiones religiosas, y trabaja por el fortalecimiento y articulación de la sociedad civil en torno a la consecución de cambios estructurales que permitan la realización de los derechos humanos con énfasis en los derechos colectivos de los sectores más vulnerables de la sociedad, a la construcción de una cultura basada en el pluralismo, la democracia participativa y comunitaria, y a la distribución y reconfiguración de los poderes en el Estado Plurinacional.